More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2512 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.43 
 
 
587 aa  767    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  65.25 
 
 
585 aa  748    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  67.26 
 
 
587 aa  765    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  85.56 
 
 
579 aa  1018    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  68.06 
 
 
574 aa  770    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.78 
 
 
579 aa  748    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  100 
 
 
591 aa  1209    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.22 
 
 
539 aa  349  8e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.94 
 
 
539 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.85 
 
 
539 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.24 
 
 
552 aa  344  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.64 
 
 
546 aa  342  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.92 
 
 
589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.29 
 
 
542 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.73 
 
 
608 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.69 
 
 
638 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.88 
 
 
540 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.4 
 
 
543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.13 
 
 
542 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.98 
 
 
562 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.65 
 
 
598 aa  300  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  37.79 
 
 
646 aa  298  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.39 
 
 
648 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.39 
 
 
648 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
627 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.11 
 
 
568 aa  296  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.39 
 
 
648 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.91 
 
 
646 aa  294  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  37.17 
 
 
609 aa  293  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.44 
 
 
644 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.9 
 
 
587 aa  292  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.74 
 
 
566 aa  289  8e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  38.61 
 
 
598 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.84 
 
 
578 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.7 
 
 
646 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.89 
 
 
644 aa  287  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.27 
 
 
612 aa  287  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
623 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.81 
 
 
596 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.64 
 
 
567 aa  283  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.01 
 
 
643 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.01 
 
 
621 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.52 
 
 
566 aa  277  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  36.8 
 
 
568 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.71 
 
 
567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.24 
 
 
575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.33 
 
 
582 aa  273  6e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.13 
 
 
575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.12 
 
 
637 aa  270  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.45 
 
 
581 aa  270  5e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  38.22 
 
 
567 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.12 
 
 
581 aa  270  5e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  32.49 
 
 
570 aa  270  5e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.41 
 
 
567 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  34.59 
 
 
594 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1283  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.56 
 
 
612 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.714397  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  32.7 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.38 
 
 
591 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.21 
 
 
637 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.12 
 
 
576 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  35.41 
 
 
584 aa  267  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.19 
 
 
567 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.62 
 
 
567 aa  267  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.21 
 
 
587 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.54 
 
 
579 aa  266  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.39 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.56 
 
 
591 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.46 
 
 
567 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  35.62 
 
 
633 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.16 
 
 
575 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  34.66 
 
 
641 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.23 
 
 
602 aa  265  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.11 
 
 
575 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.11 
 
 
575 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.67 
 
 
591 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.67 
 
 
591 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.09 
 
 
595 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  33.45 
 
 
573 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  38.29 
 
 
567 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  34.55 
 
 
596 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.71 
 
 
542 aa  262  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.17 
 
 
603 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.5 
 
 
591 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.5 
 
 
591 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.5 
 
 
591 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.5 
 
 
591 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.5 
 
 
591 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0463  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.84 
 
 
611 aa  260  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.61 
 
 
598 aa  259  8e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0488  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.77 
 
 
576 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.332185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.8 
 
 
626 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.01 
 
 
584 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.31 
 
 
592 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34 
 
 
601 aa  257  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>