208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5899 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5899  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 294 aa  583  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5883  alpha/beta hydrolase fold protein  77.14 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6152  alpha/beta hydrolase fold protein  71.71 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2841  putative hydrolase  33.2 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2285  putative hydrolase  33.2 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.45293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  40.2 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  44.87 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  29.91 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.71 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  22.9 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.83 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  34.09 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.02 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.33 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.02 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.91 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  34.4 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  20.15 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  33.04 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  26.29 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  43.02 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  29.46 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  26.98 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.08 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  41.77 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  30.25 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  30.25 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  20.25 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  33.96 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  34.58 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  27.19 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  28.46 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  28.46 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  35.92 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>