More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0450 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  58.4 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  58.67 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  54.75 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  53.15 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  52.54 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  51.47 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  53.25 
 
 		 409 aa  322  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 418 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 425 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.49 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.01 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  24.38 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  26.57 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 411 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 418 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  23.75 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.75 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 407 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.23 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.23 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  27.69 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.43 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  27.29 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  27.05 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  26.88 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.14 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  27.34 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  27.34 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  27.34 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  26.77 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  24.23 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  22.82 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  23.05 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>