More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0227 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0227  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  45.23 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.72 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  43.35 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  42.29 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  39.22 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  42.13 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  38.24 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  41.62 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  37.81 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  37.93 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  41.62 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  36.95 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  39.3 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  38.61 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  43.27 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  40.89 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.46 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  42.29 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  37.81 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  42.69 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  38.81 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  36.68 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  38.61 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  37.13 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  39.42 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  36.45 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  36.32 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  36.32 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  43.4 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  38.61 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  36.27 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  39.3 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  37.93 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  35.96 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  40.35 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  43.4 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  38.66 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  39.66 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  35.5 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  43.18 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  37.69 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  43.21 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  45.96 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  43.21 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  38.97 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  37.44 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  41.07 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  39.09 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf442  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  35.82 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  39.7 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  34.76 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  33.82 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  36.23 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  35.14 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  35.45 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  34.3 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  38.38 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  37.31 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  35.82 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  34.34 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  35.26 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  34.72 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  37.43 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  36.6 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>