More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1474 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  51.42 
 
 
670 aa  663    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
667 aa  1381    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  50.67 
 
 
665 aa  631  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  47.98 
 
 
667 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  47.22 
 
 
667 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  44.14 
 
 
667 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  46.11 
 
 
665 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  52.08 
 
 
338 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3897  aldo/keto reductase  53.63 
 
 
328 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3216  aldo/keto reductase  52.37 
 
 
320 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1199  aldo/keto reductase  44.1 
 
 
316 aa  267  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  39.12 
 
 
329 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  34.42 
 
 
342 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  33.53 
 
 
342 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  38.64 
 
 
329 aa  219  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  39.22 
 
 
330 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  38.62 
 
 
344 aa  203  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 
331 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  34.4 
 
 
329 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  33.92 
 
 
354 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 
332 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
337 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
332 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  36.04 
 
 
320 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.69 
 
 
334 aa  180  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 
336 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 
338 aa  177  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.78 
 
 
333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
331 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
330 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  37.57 
 
 
379 aa  170  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 
334 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
324 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 
325 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
329 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
327 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
340 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  34.02 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  32.43 
 
 
330 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
352 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  30.81 
 
 
328 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.93 
 
 
328 aa  163  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
338 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 
352 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
338 aa  162  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
345 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
336 aa  160  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
356 aa  160  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
321 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32.62 
 
 
328 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 
346 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.91 
 
 
334 aa  157  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  36.31 
 
 
322 aa  157  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.77 
 
 
359 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  31.9 
 
 
345 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
332 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  31.73 
 
 
326 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  33.07 
 
 
323 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 
342 aa  153  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
322 aa  153  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 
349 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  33.07 
 
 
324 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.33 
 
 
328 aa  151  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 
341 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.96 
 
 
328 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  34.52 
 
 
331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
327 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.22 
 
 
338 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 
335 aa  148  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
338 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
357 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  32.14 
 
 
388 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  35.93 
 
 
338 aa  146  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 
328 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
362 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  31.13 
 
 
349 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 
323 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.95 
 
 
358 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  31.7 
 
 
342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2027  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
337 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  34.45 
 
 
328 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
328 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3685  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
320 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  28.61 
 
 
351 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 
342 aa  138  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 
335 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  30.55 
 
 
338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  37.84 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  29.5 
 
 
334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
354 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  28.53 
 
 
374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  29.29 
 
 
329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.38 
 
 
349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.38 
 
 
349 aa  132  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
332 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
370 aa  130  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  38.58 
 
 
343 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  27.02 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>