More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3631 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  75 
 
 		 241 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  78.07 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  78.07 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  78.07 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  77.63 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  77.63 
 
 		 247 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  77.19 
 
 		 238 aa  362  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.81 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.11 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  63.44 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  61.47 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.42 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  63.44 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.68 
 
 		 239 aa  274  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.33 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.87 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.56 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.94 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 237 aa  271  9e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.12 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  57.39 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  58.59 
 
 		 229 aa  264  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  56 
 
 		 246 aa  264  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.91 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  59.47 
 
 		 406 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  57.64 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.02 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.44 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  54.81 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.96 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  57.96 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  56.44 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  54.94 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  56.07 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  57.96 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  51.25 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 231 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  56.39 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.96 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 239 aa  242  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  54.78 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.87 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.34 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 252 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  48.09 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  52.86 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  51.79 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.45 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  54.67 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.78 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.78 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.78 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>