More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1824 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 309 aa  613  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  56.94 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  56.94 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  57.48 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  56.6 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  52.94 
 
 		 341 aa  315  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  54.95 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  52.7 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  53.1 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  48.6 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  50.69 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  48.68 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  49.13 
 
 		 301 aa  268  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  48.16 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  47.64 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  45.82 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.42 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  27.17 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  27.88 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  27.17 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  26.82 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  27.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  27.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  27.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  27.17 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 405 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 271 aa  99  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.62 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 462 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.3 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 271 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.92 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.93 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.05 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.92 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.36 
 
 		 258 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.05 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.05 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.14 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 		 456 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.52 
 
 		 265 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.17 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>