More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0784 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 354 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40.24 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  38.73 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  34.25 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  33.65 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  28.74 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  29.75 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  32.51 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  33.6 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.37 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  28.36 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  28.18 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  29.22 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.05 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  30.4 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 318 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.91 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.92 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  27.4 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  27.4 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  29.72 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.4 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.71 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  30.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  29.02 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  29.85 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  28.85 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.71 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.59 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.19 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  29.22 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27.3 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  35.5 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  28 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  37.08 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.44 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.07 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  26.69 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>