More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0030 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
494 aa  997  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  78.79 
 
 
495 aa  817  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  76.02 
 
 
495 aa  750  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  83.6 
 
 
494 aa  862  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  47.37 
 
 
522 aa  382  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  46.85 
 
 
543 aa  371  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  40.16 
 
 
503 aa  325  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.93 
 
 
498 aa  318  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.85 
 
 
476 aa  313  4e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.8 
 
 
652 aa  301  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.98 
 
 
649 aa  298  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.42 
 
 
649 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.42 
 
 
649 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.42 
 
 
649 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  36.73 
 
 
507 aa  295  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  2.16588e-06 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.64 
 
 
483 aa  274  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.28 
 
 
490 aa  267  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.61 
 
 
489 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  37.18 
 
 
606 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.44 
 
 
489 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.99 
 
 
489 aa  254  4e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.4 
 
 
500 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.56 
 
 
491 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.6 
 
 
491 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.48 
 
 
481 aa  245  1e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35 
 
 
484 aa  244  2e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.5 
 
 
483 aa  240  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.14 
 
 
482 aa  230  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  28.85 
 
 
344 aa  114  4e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  28 
 
 
370 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.98 
 
 
377 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.12 
 
 
369 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.3 
 
 
371 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.3 
 
 
371 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.05 
 
 
362 aa  106  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.63 
 
 
370 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.83 
 
 
371 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.55 
 
 
368 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.83 
 
 
377 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.62 
 
 
368 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
381 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
370 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.11 
 
 
374 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.4 
 
 
372 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.83 
 
 
377 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
381 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.12 
 
 
375 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.33 
 
 
367 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
374 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
374 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
374 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
368 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
368 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.65402e-10  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.28 
 
 
380 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.97 
 
 
387 aa  100  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87089e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 
377 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.30572e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
373 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.70638e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 
377 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 
387 aa  99.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 
379 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 
379 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.7 
 
 
407 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.51 
 
 
372 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.86 
 
 
377 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
380 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.22 
 
 
392 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.35 
 
 
392 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.63 
 
 
379 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.11 
 
 
373 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
392 aa  97.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.76 
 
 
371 aa  96.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.94 
 
 
371 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.75 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.41 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  29.52 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.98 
 
 
379 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.82 
 
 
388 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.31 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.21 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.43926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  24.03 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.84 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 
382 aa  94.4  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.47 
 
 
382 aa  94.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>