More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2170 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
768 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.25 
 
 
768 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  42.7 
 
 
786 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  42.6 
 
 
787 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
784 aa  1592    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  44.78 
 
 
796 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.3 
 
 
784 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  52.45 
 
 
765 aa  809    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.63 
 
 
758 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  42.8 
 
 
795 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
769 aa  790    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  43.52 
 
 
791 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  42.55 
 
 
790 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  57.96 
 
 
761 aa  926    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  52.09 
 
 
784 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  57.42 
 
 
770 aa  921    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.63 
 
 
770 aa  759    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
769 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  47.84 
 
 
766 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  43.06 
 
 
796 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.3 
 
 
770 aa  754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  51.25 
 
 
769 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  48.11 
 
 
758 aa  748    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
768 aa  790    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  55.89 
 
 
760 aa  847    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  49.17 
 
 
766 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
768 aa  788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  51.62 
 
 
781 aa  735    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
769 aa  789    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.25 
 
 
769 aa  782    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.45 
 
 
781 aa  757    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  42.57 
 
 
786 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  42.6 
 
 
787 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  49.74 
 
 
779 aa  748    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  50.45 
 
 
765 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.45 
 
 
765 aa  766    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  53.72 
 
 
790 aa  880    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  48.78 
 
 
784 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  49.55 
 
 
767 aa  765    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.42 
 
 
769 aa  760    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  52.93 
 
 
791 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  43.16 
 
 
786 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  48.7 
 
 
765 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.39 
 
 
765 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  51.3 
 
 
765 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  50.99 
 
 
769 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
768 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.71 
 
 
765 aa  813    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  51.12 
 
 
768 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  46.9 
 
 
800 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.93 
 
 
750 aa  813    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.32 
 
 
770 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  50.99 
 
 
768 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  43.49 
 
 
794 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  50.99 
 
 
769 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.73 
 
 
799 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.38 
 
 
769 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.33 
 
 
797 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.92 
 
 
769 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.06 
 
 
811 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.27 
 
 
787 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  42.46 
 
 
788 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  42.54 
 
 
792 aa  632  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.1 
 
 
787 aa  623  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  41.38 
 
 
784 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.25 
 
 
784 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.1 
 
 
780 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  40.58 
 
 
790 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.95 
 
 
781 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  38.95 
 
 
781 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  39.65 
 
 
772 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  39.98 
 
 
801 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  40.62 
 
 
799 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  39.43 
 
 
809 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  39.68 
 
 
805 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  39.11 
 
 
803 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  39.11 
 
 
803 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.61 
 
 
804 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  39.02 
 
 
807 aa  542  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  38.18 
 
 
780 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.19 
 
 
810 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.19 
 
 
810 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.88 
 
 
815 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  37.28 
 
 
804 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.28 
 
 
803 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  38.01 
 
 
770 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  38.01 
 
 
770 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.41 
 
 
800 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.2 
 
 
795 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.2 
 
 
795 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.76 
 
 
810 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  38.2 
 
 
795 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>