More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1245 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  47.26 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.82 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.4 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.69 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  34.93 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.69 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.54 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.84 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.19 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.47 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  37.41 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  36.4 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  36.4 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  35.71 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.65 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 311 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.22 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  37.64 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.11 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  34.04 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.18 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.33 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.33 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.6 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.45 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  35.89 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  33.22 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  35.21 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 328 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 328 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.94 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  35.4 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  36.52 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  28.87 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 356 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.16 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.89 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 304 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  30.58 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>