More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0032 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  100 
 
 		 316 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  32.66 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  36.05 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  37.99 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 343 aa  201  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.32 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.45 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.45 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  37.72 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.46 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.17 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.09 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.77 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.17 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  36.69 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.4 
 
 		 299 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.79 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.79 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.79 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.17 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.66 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.76 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  35.51 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  35.94 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  35.94 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  35.59 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.83 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34.8 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  33.9 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  37.36 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  38.67 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.02 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  35.44 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  32.7 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  32.39 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  32.39 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  32.39 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  32.08 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  37.69 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  34.55 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.68 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.68 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.68 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  35.47 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 342 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  33.58 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>