More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1544 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  100 
 
 
566 aa  1128    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  45.66 
 
 
570 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  46.06 
 
 
567 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  44.88 
 
 
565 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  42.11 
 
 
579 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  41.49 
 
 
579 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 
579 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  42.11 
 
 
579 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  41.42 
 
 
573 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  41.32 
 
 
583 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  41.32 
 
 
579 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  41.32 
 
 
583 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  41.32 
 
 
579 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 
579 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  41.59 
 
 
579 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 
573 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  43.01 
 
 
562 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.27 
 
 
577 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  41.42 
 
 
579 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  43.09 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  42.58 
 
 
565 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  43.01 
 
 
565 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 
558 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 
554 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  41.22 
 
 
580 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 
558 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 
559 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 
559 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 
559 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  39.1 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  39.32 
 
 
556 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 
574 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 
601 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 
552 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 
554 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
551 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 
555 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 
556 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  36.29 
 
 
599 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  37.7 
 
 
555 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  38.98 
 
 
558 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 
553 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  39.24 
 
 
588 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  39.24 
 
 
588 aa  379  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.07 
 
 
586 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  39.21 
 
 
553 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  39.89 
 
 
552 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 
565 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  39.24 
 
 
588 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 
561 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 
561 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 
572 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.85 
 
 
553 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.82 
 
 
587 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  37.83 
 
 
560 aa  364  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 
572 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  36.49 
 
 
562 aa  353  5e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.62 
 
 
578 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 
560 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.17 
 
 
605 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  39.82 
 
 
560 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  34.53 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 
572 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 
551 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 
569 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 
568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 
595 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 
575 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 
574 aa  321  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  34.23 
 
 
553 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  34.23 
 
 
553 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 
554 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 
562 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 
567 aa  318  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.78 
 
 
554 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  34.64 
 
 
567 aa  317  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  34.23 
 
 
553 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 
553 aa  317  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  34.05 
 
 
553 aa  317  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  34.05 
 
 
553 aa  317  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.11 
 
 
554 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  34.23 
 
 
553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  34.05 
 
 
553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.23 
 
 
553 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.23 
 
 
553 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.23 
 
 
553 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  34.17 
 
 
553 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.05 
 
 
553 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 
564 aa  312  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 
582 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 
542 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 
555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  34.47 
 
 
553 aa  309  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.83 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.83 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.83 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.83 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>