More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4473 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  47.68 
 
 		 778 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  52.96 
 
 		 710 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  53.56 
 
 		 647 aa  673    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 677 aa  1380    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  45.29 
 
 		 783 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  49.08 
 
 		 793 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  46.37 
 
 		 725 aa  591  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  55.42 
 
 		 790 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  48.69 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  43.54 
 
 		 794 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  44.05 
 
 		 793 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  43.65 
 
 		 787 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  59.07 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.83 
 
 		 680 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  54.92 
 
 		 763 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  44.95 
 
 		 676 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  44.95 
 
 		 676 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  44.22 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.62 
 
 		 676 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  41.84 
 
 		 708 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  52.9 
 
 		 829 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  40.68 
 
 		 658 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  40.65 
 
 		 659 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  41.52 
 
 		 655 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  40.11 
 
 		 670 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  38.68 
 
 		 725 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  39.66 
 
 		 661 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  39.97 
 
 		 661 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  54.69 
 
 		 552 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  40.06 
 
 		 661 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  38.92 
 
 		 728 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  40.63 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  36.37 
 
 		 806 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  36.59 
 
 		 709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  40.76 
 
 		 683 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  39.77 
 
 		 673 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  39.42 
 
 		 686 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.63 
 
 		 663 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  45.23 
 
 		 675 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  45.23 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.74 
 
 		 644 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  39.23 
 
 		 589 aa  422  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  36.94 
 
 		 661 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  45 
 
 		 580 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  44.36 
 
 		 587 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  37.05 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  42.25 
 
 		 777 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  42.32 
 
 		 592 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  34.69 
 
 		 659 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  42.26 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  35.72 
 
 		 675 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  35.47 
 
 		 675 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  32.35 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  37.8 
 
 		 799 aa  306  9.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  46.97 
 
 		 371 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  41.72 
 
 		 316 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  55.79 
 
 		 196 aa  198  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  31.71 
 
 		 697 aa  160  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  27.18 
 
 		 498 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  26.46 
 
 		 574 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.51 
 
 		 574 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.89 
 
 		 497 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  32.48 
 
 		 585 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  26.53 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.8 
 
 		 587 aa  137  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.68 
 
 		 505 aa  137  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.48 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  26.5 
 
 		 908 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  32.63 
 
 		 496 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  30.13 
 
 		 528 aa  125  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.97 
 
 		 504 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  31.67 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.24 
 
 		 505 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.49 
 
 		 516 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  27.73 
 
 		 540 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.16 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  30.38 
 
 		 873 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.9 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  29.69 
 
 		 822 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.96 
 
 		 522 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.32 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.23 
 
 		 523 aa  120  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.92 
 
 		 508 aa  120  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 		 530 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 		 530 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  27.97 
 
 		 539 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 544 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  26.86 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  28.83 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  25.25 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  30.33 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  27.83 
 
 		 511 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  23.9 
 
 		 516 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  29.55 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  28.75 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 523 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>