286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4662 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  61.86 
 
 
313 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  43.27 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  43.62 
 
 
311 aa  215  8e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  43.28 
 
 
304 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  40.86 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  37.54 
 
 
319 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
308 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  35.22 
 
 
637 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  34.97 
 
 
644 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
326 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
333 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
302 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.39 
 
 
298 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
342 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
312 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 
323 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.17 
 
 
287 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  31.96 
 
 
319 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.91 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
317 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  32.47 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.73 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.48 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.75 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.08 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.66 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.49 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.34 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.34 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.1 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  33.21 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  27.83 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  29.23 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.17 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  30.89 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  28 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  24.91 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.93 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  29.23 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.1 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.72 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.09 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.38 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.29 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  31.42 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  26.13 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.48 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.7 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>