More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1621 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 327 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 301 aa  338  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  63.7 
 
 		 350 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  51.56 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  39.84 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  36.1 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 305 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 296 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  39.84 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  37.94 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  38.87 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  38.27 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  30.96 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.94 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  35.04 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  37.35 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  32.79 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.21 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>