More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1556 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  63.73 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  65.2 
 
 
210 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  59.41 
 
 
207 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  60.29 
 
 
208 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  54.76 
 
 
218 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 
210 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  48 
 
 
204 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 
234 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 
198 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  46.04 
 
 
232 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  44.28 
 
 
210 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  45 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  46.7 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  41.29 
 
 
203 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  48.73 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
225 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 
204 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.23 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 
214 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 
232 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  41.83 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
206 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  41.27 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  42.23 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.58 
 
 
365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.58 
 
 
365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.58 
 
 
365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.28 
 
 
369 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.27 
 
 
382 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
222 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.91 
 
 
222 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  40.37 
 
 
211 aa  104  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
214 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
208 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  39.34 
 
 
213 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 
440 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  44.22 
 
 
206 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.89 
 
 
205 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.94 
 
 
442 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 
223 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.64 
 
 
442 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.09 
 
 
442 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.73 
 
 
442 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
201 aa  99  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
201 aa  99  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
211 aa  99  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  47.2 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
402 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.84 
 
 
442 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
378 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.96 
 
 
378 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  46.48 
 
 
391 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.29 
 
 
443 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
213 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.71 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
190 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 
202 aa  95.5  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  38.8 
 
 
210 aa  95.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.34 
 
 
356 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
411 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  42.41 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.04 
 
 
427 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  37.21 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
445 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  39.11 
 
 
197 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 
196 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
200 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.93 
 
 
200 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.82 
 
 
442 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
200 aa  92  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  31.65 
 
 
272 aa  91.7  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
459 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  48.98 
 
 
208 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  42.77 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>