More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0098 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
300 aa  611  1e-174  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
301 aa  254  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  47.92 
 
 
301 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  47.92 
 
 
301 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  47.92 
 
 
301 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
311 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 
293 aa  243  2e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  46.26 
 
 
304 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  46.53 
 
 
301 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  45.14 
 
 
301 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.29 
 
 
310 aa  234  2e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
301 aa  233  4e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.66 
 
 
301 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  46.55 
 
 
291 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
301 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.92 
 
 
309 aa  230  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
301 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 
316 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  43.71 
 
 
292 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
301 aa  219  4e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
320 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
351 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.07 
 
 
307 aa  214  1e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
295 aa  214  2e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 
292 aa  213  3e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  41.16 
 
 
292 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
308 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.98 
 
 
310 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.52 
 
 
301 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
308 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
307 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.84 
 
 
317 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  2.86322e-06 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
303 aa  201  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.73 
 
 
307 aa  201  2e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.73 
 
 
307 aa  201  2e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
309 aa  200  2e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 
306 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.04 
 
 
306 aa  197  1e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
305 aa  197  2e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.58 
 
 
309 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 
292 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
296 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
298 aa  190  3e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
299 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
296 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
302 aa  184  1e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 
300 aa  184  2e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 
332 aa  182  4e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
305 aa  183  4e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
303 aa  182  8e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
301 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  38.76 
 
 
292 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
303 aa  179  5e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
301 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
287 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  39.66 
 
 
304 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
287 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.31 
 
 
247 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
288 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
287 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
302 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
710 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.84 
 
 
251 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.12417e-05  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
304 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
304 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
301 aa  174  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
298 aa  174  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
303 aa  174  2e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
304 aa  174  2e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
305 aa  174  2e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
301 aa  174  2e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.58 
 
 
246 aa  172  4e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  45.54 
 
 
903 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
913 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
287 aa  172  7e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
310 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
306 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
300 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  39.93 
 
 
305 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  6.05367e-08 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
303 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.15 
 
 
245 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  38.05 
 
 
901 aa  169  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
303 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  40.28 
 
 
286 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.38 
 
 
248 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  41.22 
 
 
893 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.94 
 
 
250 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.35 
 
 
306 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  42.23 
 
 
252 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
251 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
246 aa  167  3e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.15 
 
 
246 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  8.46656e-14 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.15 
 
 
246 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
301 aa  165  1e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.97 
 
 
246 aa  164  1e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.38 
 
 
305 aa  164  2e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 
246 aa  164  2e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
326 aa  163  4e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
303 aa  162  5e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 
304 aa  162  5e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>