More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2101 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  44.86 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 222 aa  168  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 221 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 226 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  40.32 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 231 aa  150  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  44.86 
 
 		 223 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 230 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  40.12 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  42.02 
 
 		 221 aa  141  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  41.85 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  42.02 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 253 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 219 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 221 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  37.77 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 220 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  37.43 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 		 114 aa  104  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 124 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  53.16 
 
 		 124 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.98 
 
 		 454 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  31.73 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  38.54 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  36.08 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.59 
 
 		 550 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.09 
 
 		 562 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.563654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  30.1 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  37.5 
 
 		 820 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 459 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  33.71 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.09 
 
 		 581 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  29.52 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.87 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.53 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.51 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  33.73 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  33.73 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0342  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.18 
 
 		 938 aa  55.5  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>