150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2480 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
159 aa  314  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  53.38 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
180 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
183 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  41.09 
 
 
181 aa  84.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.35 
 
 
216 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 
722 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  38.26 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39.52 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  38.89 
 
 
817 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 
855 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 
697 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  36.96 
 
 
282 aa  67.4  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.13 
 
 
549 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.97 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.72 
 
 
573 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
1039 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.7 
 
 
579 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39.22 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.97 
 
 
1045 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.7 
 
 
202 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.52 
 
 
738 aa  60.5  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.1 
 
 
591 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.81 
 
 
616 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.06 
 
 
234 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
713 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
207 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 
119 aa  57.4  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
192 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
203 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
122 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.75 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.85 
 
 
613 aa  53.9  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.14 
 
 
281 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 
744 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.93 
 
 
256 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  36.8 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.79 
 
 
743 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  37.39 
 
 
365 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.82 
 
 
952 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  40.91 
 
 
145 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
356 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2541  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.3 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.7405  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  35.71 
 
 
694 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  36.97 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.94 
 
 
750 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  34.82 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 
754 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  37.29 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  31.9 
 
 
746 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.75 
 
 
355 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
211 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  33.94 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  28.95 
 
 
753 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  36.08 
 
 
135 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  35.48 
 
 
528 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  33.06 
 
 
281 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>