287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2162 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  37.18 
 
 
271 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 
283 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
282 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
269 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
268 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  30 
 
 
279 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  34.69 
 
 
238 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  30.71 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
262 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.65 
 
 
261 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 
294 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 
250 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
235 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  31.96 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 
299 aa  92  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  28.25 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  32.96 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  29.18 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.94 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  27.37 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  31.28 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.07 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  25.91 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  32.74 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.49 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  28.4 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  31.85 
 
 
136 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  30 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  32.23 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  33.07 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  33.07 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 
249 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  32.85 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  30.63 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  26.99 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.11 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  25.81 
 
 
94 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 
176 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  23.74 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  27.07 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  26.9 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  27.88 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
326 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  24.6 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  27.53 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
315 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  23.31 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
241 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 
329 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  25.43 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
248 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>