More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1720 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  84.58 
 
 		 201 aa  315  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.5 
 
 		 212 aa  278  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.16 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.67 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.19 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.5 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.5 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.66 
 
 		 201 aa  239  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  61.69 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  69.5 
 
 		 205 aa  237  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.18 
 
 		 201 aa  234  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.18 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  58.71 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  62.12 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  59.7 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  59.9 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  58.71 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  59.2 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  49.75 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.73 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.5 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  49.25 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  51 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.37 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.73 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.73 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.71 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.73 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.97 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 201 aa  187  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  55.72 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 198 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.21 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  47.85 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  49 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  49 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  49 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  49 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  47.55 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  47.5 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.73 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  43.41 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.29 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.76 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.76 
 
 		 144 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 200 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  35.32 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  47.26 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 200 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4244  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.89 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  35.78 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 222 aa  141  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 216 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.99 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  36.74 
 
 		 218 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>