More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1285 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  100 
 
 
585 aa  1153    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
598 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  42.58 
 
 
556 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.81 
 
 
598 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  43.06 
 
 
601 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.73 
 
 
585 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.65 
 
 
579 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  38.88 
 
 
622 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
600 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 
602 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  38.03 
 
 
575 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  40.99 
 
 
606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  40.41 
 
 
601 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.41 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  40.52 
 
 
618 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  40.31 
 
 
584 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
586 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  34.28 
 
 
591 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.81 
 
 
580 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.58 
 
 
589 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  37.13 
 
 
584 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  41.24 
 
 
608 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.09 
 
 
600 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  38.7 
 
 
611 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  35.33 
 
 
614 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  37.6 
 
 
635 aa  392  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
623 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37.48 
 
 
571 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  39.12 
 
 
597 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  38.67 
 
 
640 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.32 
 
 
597 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.32 
 
 
597 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.19 
 
 
602 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  38.26 
 
 
587 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  39.23 
 
 
582 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36 
 
 
572 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.24 
 
 
577 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.89 
 
 
592 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.74 
 
 
590 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.48 
 
 
580 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  40.55 
 
 
575 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.24 
 
 
597 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.39 
 
 
579 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  39.92 
 
 
546 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.66 
 
 
614 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1638  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.24 
 
 
604 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  41.54 
 
 
600 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  36.71 
 
 
550 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  34.86 
 
 
589 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  39.12 
 
 
601 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.53 
 
 
574 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  38.42 
 
 
603 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.09 
 
 
592 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.53 
 
 
574 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  35.84 
 
 
588 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  37.3 
 
 
579 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  37.97 
 
 
603 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  38.36 
 
 
610 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.85 
 
 
617 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.37 
 
 
600 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.67 
 
 
575 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
636 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  35.27 
 
 
636 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 
586 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 
586 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  38.02 
 
 
611 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  37.29 
 
 
578 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.39 
 
 
619 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.83 
 
 
623 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  37.16 
 
 
613 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 
611 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.33 
 
 
600 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  38.36 
 
 
611 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.09 
 
 
617 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.87 
 
 
602 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.24 
 
 
592 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.85 
 
 
602 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  37.74 
 
 
592 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.3 
 
 
586 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  36.57 
 
 
580 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  35.93 
 
 
601 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.35 
 
 
586 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  38.19 
 
 
597 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.35 
 
 
586 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.33 
 
 
581 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.4 
 
 
597 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  35 
 
 
611 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  37.57 
 
 
571 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39 
 
 
584 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.59 
 
 
611 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 
586 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.87 
 
 
581 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  39.9 
 
 
594 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  35.8 
 
 
602 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.27 
 
 
601 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.27 
 
 
601 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.96 
 
 
583 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  35.95 
 
 
631 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  36.22 
 
 
580 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>