213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0692 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0692  Fe-S cluster domain protein  100 
 
 
434 aa  884    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  33.92 
 
 
460 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 
443 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  34.17 
 
 
448 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3798  Fe-S cluster domain-containing protein  34.19 
 
 
427 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.818918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  32.35 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  30.96 
 
 
443 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  30.79 
 
 
443 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  24.64 
 
 
571 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.1 
 
 
748 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  25.48 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  24.07 
 
 
577 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  22.78 
 
 
569 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  22.66 
 
 
584 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  25.52 
 
 
752 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  21.05 
 
 
574 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  23.34 
 
 
559 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  21.2 
 
 
576 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  23.93 
 
 
755 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  24.58 
 
 
583 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  24.05 
 
 
756 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  23.93 
 
 
759 aa  99.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.89 
 
 
542 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  23.7 
 
 
759 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  24.53 
 
 
763 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  24.5 
 
 
580 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.74 
 
 
521 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  25.12 
 
 
747 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.97 
 
 
521 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  22.57 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.09 
 
 
550 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  22.25 
 
 
877 aa  90.1  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  21.59 
 
 
556 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  24.32 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.2 
 
 
519 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  24.51 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  22.95 
 
 
491 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  27.21 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  22.43 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  20.85 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  24.06 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  19.86 
 
 
573 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  21.4 
 
 
696 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  22.58 
 
 
667 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  20.75 
 
 
666 aa  66.6  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  24.78 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  24.92 
 
 
454 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  22.14 
 
 
460 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  24.92 
 
 
488 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  23.16 
 
 
483 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  24.53 
 
 
601 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  22.7 
 
 
566 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  24.77 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  25.11 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  24.31 
 
 
410 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  21.71 
 
 
567 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  23.85 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.85 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  23.78 
 
 
490 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  20.85 
 
 
653 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  21.3 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  22.15 
 
 
531 aa  57.8  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  20.54 
 
 
482 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  21.31 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  21.39 
 
 
572 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1492  iron-sulfur cluster-binding protein  28.7 
 
 
291 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00658416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  27.4 
 
 
644 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  21.28 
 
 
572 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  21.61 
 
 
594 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  19.73 
 
 
562 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  22.88 
 
 
570 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  23.12 
 
 
527 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  26.64 
 
 
615 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  24.08 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.68 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  24.12 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 
297 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000287541  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  24.88 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
60 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  21.63 
 
 
569 aa  50.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  20.55 
 
 
387 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  24.24 
 
 
429 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  21.4 
 
 
696 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  27.91 
 
 
272 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  22.94 
 
 
1150 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  24.86 
 
 
513 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  23.55 
 
 
579 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  21.65 
 
 
581 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1980  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.24 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  22.69 
 
 
523 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.75 
 
 
439 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02630  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  41.07 
 
 
57 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.862545 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  23.81 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  22.14 
 
 
582 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  23.91 
 
 
578 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.58 
 
 
272 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  22.22 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.25 
 
 
283 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>