48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0319 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  43.7 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  44.96 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  40.44 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  31.94 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  29.93 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  30.6 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  29.82 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  32.06 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  29.85 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  26.28 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  32.59 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  32.12 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  42.62 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.47 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.47 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  31.43 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  33.64 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  29.08 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  26.67 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  28.87 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2883  PilT protein domain protein  36.78 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.548802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  29.08 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.89 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  28.89 
 
 		 141 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  24.44 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  26.9 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  28.83 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  25.71 
 
 		 138 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  26.76 
 
 		 139 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  27.19 
 
 		 139 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  29.79 
 
 		 159 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>