More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0088 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0088  cell cycle protein  100 
 
 
336 aa  657  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0088  cell cycle protein  96.13 
 
 
336 aa  599  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.0241e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1005  cell cycle protein  42.77 
 
 
374 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0721035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0635  cell cycle protein  42.6 
 
 
354 aa  228  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0123937  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1368  cell cycle protein  40.42 
 
 
368 aa  215  1e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  37.76 
 
 
373 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.93 
 
 
379 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 
378 aa  185  1e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 
368 aa  185  1e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.43295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 
374 aa  184  2e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.54 
 
 
368 aa  184  2e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  38.18 
 
 
382 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  34.1 
 
 
367 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 
407 aa  182  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  4.05805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 
369 aa  182  8e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  34.38 
 
 
380 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 
365 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.37002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  37.95 
 
 
403 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 
369 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.02 
 
 
371 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  34.04 
 
 
408 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  1.26174e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.05 
 
 
376 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
383 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 
378 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.11075e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  32.75 
 
 
374 aa  175  1e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  32.43 
 
 
371 aa  172  7e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  34.55 
 
 
380 aa  172  8e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.28 
 
 
423 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  32.85 
 
 
405 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  32.24 
 
 
380 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 
371 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.29 
 
 
403 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.38 
 
 
364 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  35.76 
 
 
357 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  32.94 
 
 
374 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  30.21 
 
 
417 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 
372 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  32.28 
 
 
371 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 
368 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.78779e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 
421 aa  167  3e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 
368 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  4.70166e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 
368 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.06 
 
 
387 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 
368 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  34.52 
 
 
360 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  34.06 
 
 
511 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  34.06 
 
 
511 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 
368 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  34.06 
 
 
511 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  35.6 
 
 
390 aa  166  7e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 
368 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.64 
 
 
368 aa  165  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  1.62732e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 
367 aa  164  1e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  31.4 
 
 
397 aa  165  1e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 
413 aa  165  1e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  35.76 
 
 
371 aa  164  1e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
380 aa  165  1e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 
367 aa  164  1e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.70795e-05  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  34.75 
 
 
366 aa  164  2e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
368 aa  164  2e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 
367 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  36.22 
 
 
509 aa  163  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  32.01 
 
 
373 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.47199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
373 aa  163  4e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 
378 aa  163  4e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  32.56 
 
 
383 aa  163  4e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.01202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 
408 aa  163  5e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 
368 aa  163  5e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.82729e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
368 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.18 
 
 
426 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 
373 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.63 
 
 
371 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
373 aa  162  8e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  31.72 
 
 
370 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 
368 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.11765e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 
388 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  32.01 
 
 
422 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
378 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  31.99 
 
 
404 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.23269e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.59 
 
 
354 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.9 
 
 
371 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  31.16 
 
 
422 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.64 
 
 
363 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  33.03 
 
 
376 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 
380 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  35.63 
 
 
506 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  35.83 
 
 
412 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.16 
 
 
374 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  32.08 
 
 
377 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  31.44 
 
 
422 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  32.93 
 
 
371 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 
374 aa  156  5e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  30.42 
 
 
370 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.02 
 
 
388 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  33.04 
 
 
360 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 
373 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 
387 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.24977e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  32.74 
 
 
543 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2121  cell cycle protein  35.54 
 
 
400 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0218982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  32.4 
 
 
402 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>