More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0975 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  53.76 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  58.97 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  58.87 
 
 		 196 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  58.47 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  62.71 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.26 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  58.12 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  60.34 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  47.25 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  60.55 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  57.02 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  51.39 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  57.02 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  55.08 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  57.02 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  60.71 
 
 		 237 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  58.04 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  57.02 
 
 		 217 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  59.09 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  57.63 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  56.03 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  54.26 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  52.03 
 
 		 442 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  52.59 
 
 		 174 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  59.82 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  41.11 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.43 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  59.29 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  46.56 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  46.04 
 
 		 208 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  59.65 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  51.64 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  52.31 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  57.26 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  51.22 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  48.36 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 198 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  51.97 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  52.46 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  48.36 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  51.16 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  47.54 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  47.54 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  48.36 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  52.07 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  55.12 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  47.54 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  47.54 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  47.54 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 202 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  47.54 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  59.63 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  50.39 
 
 		 146 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  51.16 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 		 224 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  56.48 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  51.94 
 
 		 203 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  59.81 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  47.54 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  45.27 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.9 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  52.99 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  48.41 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  43.4 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  54.1 
 
 		 194 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  57.41 
 
 		 222 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  49.61 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  58.18 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  51.24 
 
 		 195 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  50.82 
 
 		 196 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  52.59 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  48.85 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  54.46 
 
 		 438 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.12 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  52.76 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  49.24 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  53.72 
 
 		 212 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  48.82 
 
 		 198 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  49.65 
 
 		 209 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>