More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0040 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  100 
 
 		 550 aa  1146    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  55.15 
 
 		 552 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  55.39 
 
 		 554 aa  631  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  52.1 
 
 		 559 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  50.37 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  51.37 
 
 		 627 aa  586  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  50.64 
 
 		 559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  51.51 
 
 		 534 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  49.45 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 559 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  47.44 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  48.68 
 
 		 551 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  46.99 
 
 		 582 aa  522  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 		 593 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  47.24 
 
 		 589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  48.71 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  47.32 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  45.99 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.55 
 
 		 594 aa  487  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 		 567 aa  480  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01140  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  45.95 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0408192  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  44.34 
 
 		 616 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  43.38 
 
 		 555 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  41.97 
 
 		 563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  42.7 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  43.15 
 
 		 586 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  42.52 
 
 		 552 aa  442  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 568 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 568 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  37.5 
 
 		 562 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  38.21 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3071  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 559 aa  360  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 609 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1802  AMP-binding enzyme  37.97 
 
 		 567 aa  359  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 576 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  36.62 
 
 		 567 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  36.98 
 
 		 567 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  36.98 
 
 		 567 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0919  AMP-binding enzyme  36.98 
 
 		 567 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  37.32 
 
 		 574 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 567 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5743  putative acetate-CoA ligase  36.11 
 
 		 567 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 		 530 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1085  AMP-binding enzyme  37.04 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622614  normal  0.01656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 560 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 568 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.8 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 568 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 		 530 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 580 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 568 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 572 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  37.64 
 
 		 576 aa  336  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 528 aa  335  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  37.24 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  37.24 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  37.24 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 528 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 528 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 528 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 522 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 576 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 573 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15890  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.98 
 
 		 587 aa  331  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000158213  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 562 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 565 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.571943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 565 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  36.52 
 
 		 531 aa  327  5e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 567 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4819  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 539 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 539 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 566 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>