More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10005 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  52.52 
 
 
636 aa  645  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  87.56 
 
 
675 aa  1157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 
648 aa  685  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.25 
 
 
641 aa  675  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  49.42 
 
 
656 aa  637  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  73.87 
 
 
654 aa  993  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  87.11 
 
 
675 aa  1184  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  50.67 
 
 
637 aa  666  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  52.52 
 
 
638 aa  652  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  86.37 
 
 
675 aa  1165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  64.45 
 
 
719 aa  882  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  62.78 
 
 
661 aa  849  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  50.75 
 
 
647 aa  652  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  72.38 
 
 
657 aa  990  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  49.78 
 
 
646 aa  655  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  51.05 
 
 
642 aa  653  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  87.11 
 
 
675 aa  1184  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  59.46 
 
 
701 aa  791  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  60.15 
 
 
711 aa  746  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  72.43 
 
 
670 aa  941  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.37 
 
 
637 aa  642  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.07 
 
 
633 aa  680  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  50.76 
 
 
651 aa  648  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  52 
 
 
648 aa  681  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  49.56 
 
 
647 aa  662  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  51.03 
 
 
641 aa  659  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  61.16 
 
 
686 aa  877  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  51.05 
 
 
650 aa  659  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  61.55 
 
 
696 aa  823  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.5 
 
 
628 aa  727  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  61.23 
 
 
711 aa  773  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  51.94 
 
 
633 aa  650  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  65.32 
 
 
666 aa  848  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  51.35 
 
 
645 aa  680  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
652 aa  640  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 
636 aa  646  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 
640 aa  642  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  52.81 
 
 
644 aa  690  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.44 
 
 
640 aa  664  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.51 
 
 
633 aa  716  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  51.35 
 
 
635 aa  646  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.33 
 
 
636 aa  648  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.04 
 
 
640 aa  672  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.69 
 
 
640 aa  711  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.59 
 
 
640 aa  669  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
643 aa  637  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  53.28 
 
 
635 aa  665  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 
696 aa  772  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  49.4 
 
 
651 aa  642  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.67 
 
 
644 aa  649  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  51.11 
 
 
644 aa  657  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  667  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.91 
 
 
642 aa  653  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
636 aa  659  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  67.45 
 
 
648 aa  893  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
714 aa  1466  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 
640 aa  642  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  60.09 
 
 
720 aa  819  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  59.51 
 
 
686 aa  770  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52 
 
 
640 aa  665  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.01 
 
 
640 aa  691  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  62.24 
 
 
685 aa  792  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
650 aa  670  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  51.26 
 
 
645 aa  641  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  49.93 
 
 
637 aa  677  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  49.63 
 
 
653 aa  637  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  52.76 
 
 
642 aa  653  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  50.45 
 
 
642 aa  664  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  61.9 
 
 
695 aa  828  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  68.65 
 
 
652 aa  862  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  47.59 
 
 
650 aa  640  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  668  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  51.19 
 
 
637 aa  684  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  51.95 
 
 
638 aa  648  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.61 
 
 
634 aa  674  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  3.28066e-10  unclonable  1.30354e-08 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 
691 aa  764  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  49.11 
 
 
654 aa  651  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.62 
 
 
647 aa  872  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  49.33 
 
 
635 aa  646  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.74 
 
 
643 aa  652  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  51.05 
 
 
642 aa  655  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  65.21 
 
 
679 aa  849  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  48.13 
 
 
634 aa  636  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  667  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  67.26 
 
 
661 aa  868  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.74 
 
 
640 aa  671  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  52.69 
 
 
633 aa  683  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  49.55 
 
 
650 aa  635  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  77.01 
 
 
688 aa  1026  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  66.32 
 
 
647 aa  871  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  68.56 
 
 
680 aa  897  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  667  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  65.69 
 
 
656 aa  886  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 
644 aa  677  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
643 aa  669  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  50.6 
 
 
642 aa  648  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  49 
 
 
675 aa  683  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  63.89 
 
 
681 aa  863  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  87.11 
 
 
675 aa  1184  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54.8 
 
 
644 aa  739  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>