More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1316 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  100 
 
 		 345 aa  701    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  46.93 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  47.24 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  46.57 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  46.2 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  39.23 
 
 		 326 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  39.94 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  39.75 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  40.62 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  36.8 
 
 		 344 aa  233  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  38.64 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  38.67 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  36.72 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  34.63 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  34.57 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  36.51 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  29.73 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.08 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  32.74 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.15 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.48 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  33.02 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  30.68 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 		 294 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.6 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 292 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  28.49 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  29.13 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.76 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 302 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  25.23 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.53 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.53 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  25.17 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.61 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  27.45 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  26.03 
 
 		 299 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 293 aa  129  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.34 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  29.3 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.39 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.9 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  23.37 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  25.53 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  25.53 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  25.53 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  25.75 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.79 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.57 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>