More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0122 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  100 
 
 		 525 aa  1068    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  36.9 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  31.83 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  31.84 
 
 		 530 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  34.06 
 
 		 536 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.05 
 
 		 516 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.25 
 
 		 516 aa  253  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.05 
 
 		 516 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.37 
 
 		 516 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  30.83 
 
 		 520 aa  250  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  32.58 
 
 		 537 aa  249  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  31.45 
 
 		 535 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  31.25 
 
 		 532 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.08 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  31.45 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.55 
 
 		 533 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.86 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  47.87 
 
 		 374 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.36 
 
 		 533 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.13 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.94 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  30.65 
 
 		 528 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  34.86 
 
 		 530 aa  243  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  31.99 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  31.99 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  31.99 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  31.99 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  34.76 
 
 		 522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.99 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.99 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.7 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  29.27 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  30.6 
 
 		 542 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.2 
 
 		 528 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  30.25 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  31.12 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  31.12 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0500  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.12 
 
 		 516 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.12 
 
 		 516 aa  233  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00408  conserved inner membrane protein  30.93 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.93 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.93 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  31.48 
 
 		 530 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.5 
 
 		 498 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00412  hypothetical protein  41.83 
 
 		 406 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3335  EAL domain protein  32.16 
 
 		 540 aa  211  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  27.74 
 
 		 538 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  39.81 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  37.97 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  37 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  41.26 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  39.86 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  40.22 
 
 		 506 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.62 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  40.22 
 
 		 506 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  34.51 
 
 		 521 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  38.85 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  41.03 
 
 		 528 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  42.22 
 
 		 538 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  39.79 
 
 		 519 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.34 
 
 		 862 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  39.23 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  42.74 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  38.79 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  33.78 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  36.23 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  35.85 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  34.77 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2046  motility repressor MorA  39.52 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000887943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  35.85 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1271  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.85 
 
 		 649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  38.27 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.17 
 
 		 1040 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  35.42 
 
 		 532 aa  181  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  38.31 
 
 		 518 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  35.08 
 
 		 516 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  36.57 
 
 		 518 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  38.31 
 
 		 518 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.44 
 
 		 762 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  36.57 
 
 		 518 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  36.57 
 
 		 518 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1927  sensory box/response regulator  40.39 
 
 		 660 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2269  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.96 
 
 		 659 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.53 
 
 		 890 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3569  sensory box protein  36.89 
 
 		 1071 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 869 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.04 
 
 		 853 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  37.8 
 
 		 526 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  37.8 
 
 		 526 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.25 
 
 		 727 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2573  RNase II stability modulator  40.17 
 
 		 667 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 869 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.49 
 
 		 1514 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.49 
 
 		 1514 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>