More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0049 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  100 
 
 
144 aa  286  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  97.22 
 
 
144 aa  278  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  39.1 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  56.34 
 
 
186 aa  77  7e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  56.34 
 
 
186 aa  77  7e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  53.52 
 
 
176 aa  73.9  6e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  53.52 
 
 
176 aa  73.9  6e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  47.76 
 
 
159 aa  66.2  1e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  46.84 
 
 
178 aa  65.9  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  37.63 
 
 
187 aa  63.9  7e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  41.67 
 
 
155 aa  60.8  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  33.8 
 
 
142 aa  60.5  8e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  33.1 
 
 
142 aa  59.7  1e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
152 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  35.71 
 
 
149 aa  55.5  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  53.45 
 
 
135 aa  55.8  2e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  35.71 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  30.25 
 
 
150 aa  55.8  2e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.22428e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
165 aa  55.5  3e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.88 
 
 
168 aa  54.7  4e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  4.92385e-09 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.43 
 
 
157 aa  54.7  4e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.94 
 
 
175 aa  54.3  5e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  3.36485e-10  hitchhiker  7.27713e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  37.37 
 
 
169 aa  54.7  5e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  47.37 
 
 
179 aa  54.3  5e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  63.16 
 
 
165 aa  54.3  6e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.72 
 
 
157 aa  53.9  7e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  56.52 
 
 
196 aa  53.9  7e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 
154 aa  53.9  7e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  44.19 
 
 
179 aa  53.9  7e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 
158 aa  53.9  8e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
147 aa  53.9  8e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  45.16 
 
 
170 aa  53.5  9e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  26.98 
 
 
208 aa  53.5  9e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 
159 aa  53.1  1e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 
158 aa  53.1  1e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
144 aa  53.1  1e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.71033e-07 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
147 aa  53.1  1e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 
159 aa  53.1  1e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.94 
 
 
168 aa  52.8  2e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  28.46 
 
 
146 aa  52.4  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  34.74 
 
 
133 aa  52.8  2e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  35 
 
 
115 aa  52.4  2e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  40.4 
 
 
153 aa  52.4  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.02 
 
 
130 aa  52  2e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 
144 aa  52.8  2e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  60.53 
 
 
169 aa  52.4  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  48.21 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
166 aa  52.4  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  52.4  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
163 aa  52.8  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.3 
 
 
165 aa  52  3e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  37.5 
 
 
188 aa  51.6  3e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  52.38 
 
 
174 aa  52  3e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 
158 aa  51.6  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6497e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  42.11 
 
 
138 aa  51.6  3e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 
158 aa  52  3e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  48.21 
 
 
147 aa  51.6  4e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  44.26 
 
 
158 aa  51.2  4e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  51.2  4e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  51.2  4e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.1 
 
 
169 aa  51.6  4e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  51.2  4e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  56.1 
 
 
163 aa  51.6  4e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  47.22 
 
 
148 aa  51.6  4e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  60.53 
 
 
168 aa  50.8  5e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.11 
 
 
152 aa  51.2  5e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  54.35 
 
 
170 aa  50.8  5e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  61.54 
 
 
48 aa  51.2  5e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.85547e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 
141 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 
154 aa  50.8  5e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  56.82 
 
 
197 aa  51.2  5e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  51.2  5e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  51.2  5e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  31.76 
 
 
182 aa  51.2  5e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 
148 aa  50.8  5e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  51.2  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
155 aa  50.8  6e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
150 aa  50.8  6e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  58.49 
 
 
136 aa  50.8  6e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
144 aa  50.8  6e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  53.66 
 
 
152 aa  50.8  6e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 
144 aa  50.8  6e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  60.53 
 
 
169 aa  50.8  7e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 
144 aa  50.8  7e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
144 aa  50.4  7e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  42.11 
 
 
143 aa  50.4  7e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65425e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 
144 aa  50.4  7e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  28.87 
 
 
144 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.36 
 
 
151 aa  50.4  8e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
162 aa  50.4  8e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  60.53 
 
 
169 aa  50.4  8e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  38.46 
 
 
221 aa  50.1  9e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  55.56 
 
 
212 aa  50.1  9e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  52.38 
 
 
152 aa  50.1  9e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>