More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1956 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  89.1 
 
 		 211 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  81.99 
 
 		 211 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  79.15 
 
 		 211 aa  355  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  75.36 
 
 		 212 aa  345  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  75.36 
 
 		 211 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  68.27 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  66.83 
 
 		 210 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  66.83 
 
 		 210 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  66.83 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  56.25 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  54.76 
 
 		 211 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  54.76 
 
 		 211 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  55.77 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  57.42 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  55.98 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  53.55 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  55.24 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  44.83 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  43.75 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  47.16 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  40.76 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  40.58 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  40.87 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  36.84 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  40.58 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.67 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.08 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.08 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  39.61 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.57 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  45.56 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.52 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  43.06 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  37.2 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  40.69 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  43.78 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  44.44 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  38.84 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  37.85 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  45.23 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  38.76 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  37.98 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  42.36 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  40.67 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  39.61 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  43.43 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  40.8 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  38.86 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  44.71 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  43.43 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  41.11 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  41.11 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  36.71 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  41.38 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  37.31 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  42.53 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0227  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  40.91 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  40.8 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  43.53 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  39.73 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>