More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0005 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  54.43 
 
 		 827 aa  943    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.78 
 
 		 835 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  54.06 
 
 		 827 aa  938    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  51.63 
 
 		 835 aa  762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 		 806 aa  1606    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  82.46 
 
 		 822 aa  1322    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.41 
 
 		 813 aa  728    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  45.59 
 
 		 813 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  54.23 
 
 		 858 aa  788    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  73.24 
 
 		 829 aa  1191    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.56 
 
 		 813 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.76 
 
 		 813 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  46.37 
 
 		 873 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.42 
 
 		 848 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  50.12 
 
 		 835 aa  758    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.96 
 
 		 843 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  51.43 
 
 		 839 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  59.58 
 
 		 828 aa  1035    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  44.12 
 
 		 853 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  43.59 
 
 		 863 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  46.5 
 
 		 872 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  44.51 
 
 		 856 aa  609  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  46.65 
 
 		 869 aa  609  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  44.97 
 
 		 865 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  43.81 
 
 		 863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  46.72 
 
 		 864 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 865 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 881 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  46.26 
 
 		 865 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  44.35 
 
 		 872 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  46.93 
 
 		 857 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  46.93 
 
 		 857 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  44.12 
 
 		 886 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 872 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  44.68 
 
 		 875 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  46 
 
 		 885 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  43.33 
 
 		 802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  41.48 
 
 		 839 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  41.48 
 
 		 839 aa  552  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  40.66 
 
 		 807 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  43.39 
 
 		 812 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  40.26 
 
 		 818 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  39.66 
 
 		 825 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  39.74 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.48 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.74 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  43.07 
 
 		 913 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  40.38 
 
 		 807 aa  526  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  529  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  42.47 
 
 		 914 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  39.61 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  39.12 
 
 		 808 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  42.38 
 
 		 820 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  41.22 
 
 		 818 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  41.84 
 
 		 965 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  40.87 
 
 		 832 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  40.84 
 
 		 928 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  39.7 
 
 		 848 aa  522  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  42.7 
 
 		 911 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.82 
 
 		 821 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  42.41 
 
 		 913 aa  521  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  42.56 
 
 		 913 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  40.08 
 
 		 836 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  41.46 
 
 		 915 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  41.34 
 
 		 922 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  41.47 
 
 		 934 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  53.35 
 
 		 835 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  41.59 
 
 		 943 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 923 aa  515  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  39.34 
 
 		 809 aa  515  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1873  DNA gyrase subunit A  42.59 
 
 		 946 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4317  DNA gyrase, A subunit  42.56 
 
 		 914 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  39.47 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  41.62 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  40.29 
 
 		 930 aa  512  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  39.68 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  41.43 
 
 		 824 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  41.05 
 
 		 912 aa  512  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  40.96 
 
 		 929 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  52.63 
 
 		 897 aa  510  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  40.61 
 
 		 864 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  40.41 
 
 		 922 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  41.33 
 
 		 809 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  42.45 
 
 		 917 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  39.85 
 
 		 841 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  39.77 
 
 		 811 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  37.09 
 
 		 816 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  39.36 
 
 		 857 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  39.55 
 
 		 811 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  42.7 
 
 		 927 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  38.61 
 
 		 864 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  51.05 
 
 		 901 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  41.04 
 
 		 809 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  38.25 
 
 		 813 aa  505  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  38.77 
 
 		 843 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>