More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0186 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  53.81 
 
 		 730 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  61.65 
 
 		 675 aa  788    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  100 
 
 		 675 aa  1343    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  44.07 
 
 		 726 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  45.89 
 
 		 727 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  43.93 
 
 		 726 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  37.22 
 
 		 722 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  37.01 
 
 		 723 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  36.39 
 
 		 723 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  36.45 
 
 		 723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  33.02 
 
 		 767 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  32.8 
 
 		 765 aa  293  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  32.89 
 
 		 796 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  31.19 
 
 		 717 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  33.19 
 
 		 720 aa  263  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  33 
 
 		 709 aa  243  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.77 
 
 		 386 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.33 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.79 
 
 		 379 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  29.59 
 
 		 791 aa  174  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.1 
 
 		 379 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  31.77 
 
 		 394 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.95 
 
 		 374 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  35.31 
 
 		 369 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  29.54 
 
 		 340 aa  143  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  30.86 
 
 		 337 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 		 381 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.51 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.62 
 
 		 372 aa  128  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.96 
 
 		 358 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  32.38 
 
 		 348 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.17 
 
 		 366 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  30.14 
 
 		 342 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  30.58 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  30.61 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  28.7 
 
 		 354 aa  118  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  30.81 
 
 		 351 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  34.06 
 
 		 316 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  31.56 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.63 
 
 		 364 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  31.69 
 
 		 343 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  31.86 
 
 		 314 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  30.41 
 
 		 347 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  31.16 
 
 		 354 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  31.53 
 
 		 351 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  32.27 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  27.49 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  31.63 
 
 		 340 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.65 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  32.48 
 
 		 350 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  29.18 
 
 		 325 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.77 
 
 		 366 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  29.88 
 
 		 359 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  31.38 
 
 		 316 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  29.66 
 
 		 315 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  32.54 
 
 		 327 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  30.51 
 
 		 320 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  31.54 
 
 		 291 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  31.31 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1198  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.22 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209232  hitchhiker  0.00325073 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  32.99 
 
 		 318 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  29.05 
 
 		 320 aa  105  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  31.36 
 
 		 328 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3556  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.76 
 
 		 382 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  29.81 
 
 		 344 aa  104  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  32.82 
 
 		 343 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2262  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.01 
 
 		 370 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0065  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.11 
 
 		 369 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  30.8 
 
 		 349 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  30.07 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  30.62 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  28.75 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  30.82 
 
 		 671 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  31.48 
 
 		 328 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  33.54 
 
 		 357 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  31.25 
 
 		 317 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  31.42 
 
 		 358 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.07 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  29.07 
 
 		 317 aa  100  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  31.9 
 
 		 348 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  30.48 
 
 		 355 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  29 
 
 		 309 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  32.13 
 
 		 323 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  27.3 
 
 		 343 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  31.53 
 
 		 319 aa  99.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  31.96 
 
 		 345 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  29.05 
 
 		 308 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  31.82 
 
 		 359 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  31.79 
 
 		 348 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  29.73 
 
 		 344 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  31.79 
 
 		 348 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  26.64 
 
 		 343 aa  98.2  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  34.03 
 
 		 317 aa  97.4  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  30.42 
 
 		 350 aa  96.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  30.66 
 
 		 362 aa  96.3  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  25.77 
 
 		 358 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  31.16 
 
 		 354 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  29.69 
 
 		 357 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  31.96 
 
 		 354 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  30.32 
 
 		 347 aa  95.5  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>