62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2517 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  100 
 
 		 467 aa  959    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  43.87 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  39.13 
 
 		 469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  35.64 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  32.22 
 
 		 475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  31.65 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  32.18 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  33.33 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  32.33 
 
 		 480 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  30.84 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  30.62 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  30.64 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  29.58 
 
 		 470 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  28.66 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  27.99 
 
 		 488 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  26.02 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  26.02 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  25.21 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.49 
 
 		 533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  25.65 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  25.1 
 
 		 789 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  23.9 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  24.33 
 
 		 520 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  23.4 
 
 		 518 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  24.33 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  24.48 
 
 		 790 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  24.33 
 
 		 518 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  23.06 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  23.51 
 
 		 598 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  30.6 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  30.6 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  30.6 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  30.6 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  25.05 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  33.33 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  29.51 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  28.96 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  21.8 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  26.73 
 
 		 791 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  26.34 
 
 		 523 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.76 
 
 		 373 aa  50.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  25.43 
 
 		 533 aa  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  25.43 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  25.43 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  25.72 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  24.92 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.19 
 
 		 373 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  25.06 
 
 		 508 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.19 
 
 		 373 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  24.24 
 
 		 373 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  26.67 
 
 		 356 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  26.67 
 
 		 356 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  24.24 
 
 		 373 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.24 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  25.66 
 
 		 373 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  26.67 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  30 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  24.58 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  23.08 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.7 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  28.12 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>