More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2392 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
415 aa  856    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  70.29 
 
 
417 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  68.8 
 
 
412 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  67.97 
 
 
413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  69.55 
 
 
413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  67.23 
 
 
415 aa  578  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 
412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  67.81 
 
 
418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
411 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 
414 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
422 aa  568  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  66.99 
 
 
416 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  65.1 
 
 
413 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
412 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  64.85 
 
 
420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  65.1 
 
 
414 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 
414 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
412 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 
413 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
412 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
415 aa  555  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
413 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
414 aa  554  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
414 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
413 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
413 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.02 
 
 
410 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 
412 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
413 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 
413 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 
410 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
413 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 
415 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 
413 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 
415 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 
415 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  65.46 
 
 
417 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.02 
 
 
415 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.52 
 
 
415 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  64.02 
 
 
415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 
412 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.28 
 
 
416 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 
412 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 
425 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 
425 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 
431 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
413 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
427 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
417 aa  526  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 
414 aa  525  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
422 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
424 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 
412 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
411 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 
414 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
429 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 
414 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
425 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 
424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
417 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 
417 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
416 aa  514  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
427 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  62.28 
 
 
426 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 
438 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
419 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 
427 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
417 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
420 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
417 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
413 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
415 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 
427 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 
417 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
423 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
414 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 
427 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 
417 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 
417 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 
417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 
412 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  61.29 
 
 
417 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  58.66 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 
417 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 
423 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 
423 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.86 
 
 
427 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
411 aa  504  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.666958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>