58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0732 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  38.95 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  26.96 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  25.5 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  29.48 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  29.81 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  27.06 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  34.46 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  25.87 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  26.61 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  30.14 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  29.94 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  33.54 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  28 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  25.49 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  27.96 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  32.93 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  28.27 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  30.91 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  26.62 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  26.87 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  31.75 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  27.15 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  26.21 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  27.62 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.88 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  26.34 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  25.76 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.73 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  27.5 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  27.91 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.16 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  31.4 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.67 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  28.28 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  27.22 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.99 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  23.56 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  34.02 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 190 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  31.93 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  23.35 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  22.75 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  23.62 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  26.75 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  27.65 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  27.16 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  28.07 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5150  hypothetical protein  25.18 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9814e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  24.62 
 
 		 238 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.13 
 
 		 262 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>