More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0517 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 		 244 aa  493  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  62.15 
 
 		 226 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  59.56 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  59.91 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  57.92 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  59.11 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  58.67 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  54.32 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  59.39 
 
 		 231 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  59.39 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  52.59 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  57.14 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  98.31 
 
 		 126 aa  241  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  52.99 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  52.99 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  52.02 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  57.81 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  46.7 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  49.02 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  49.02 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  47.8 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  47.55 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  41.05 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  47.06 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  43.81 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  44.66 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  44.61 
 
 		 249 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  43.72 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  63.04 
 
 		 149 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  43.96 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  43.2 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  40.97 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  45.02 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  43.41 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  43.9 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  41.92 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  43.84 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  41.48 
 
 		 232 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  44.66 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  65.09 
 
 		 114 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  56.64 
 
 		 118 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  62.5 
 
 		 118 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  49.07 
 
 		 113 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.95 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  29.96 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  31.75 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.36 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  29.32 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  30.28 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  28.11 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  28.23 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  28.03 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  35.09 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  29.41 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2749  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.68 
 
 		 326 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  29.88 
 
 		 269 aa  92.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  28.93 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  29.63 
 
 		 292 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0905  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  27.39 
 
 		 361 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000725553  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3432  RNA polymerase sigma-38 factor  28.68 
 
 		 326 aa  91.7  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  29.63 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  27.94 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1123  RNA polymerase, sigma 28 subunit  28.68 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1194  RNA polymerase, sigma 28 subunit  28.68 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1124  RNA polymerase, sigma 38 subunit, RpoS  28.68 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  29.8 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  28.57 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2406  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  26.98 
 
 		 444 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3128  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.68 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1407  RNA polymerase sigma factor  26.17 
 
 		 438 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.723356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  55.68 
 
 		 100 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2972  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.88 
 
 		 348 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000649715  hitchhiker  0.0000217703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1245  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  28.68 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.411027  unclonable  0.00000000000310525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>