More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0050 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  49.61 
 
 
464 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  51.78 
 
 
256 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  49.61 
 
 
256 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  47.64 
 
 
257 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  47.84 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  47.83 
 
 
257 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  46.27 
 
 
255 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  46.27 
 
 
255 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  46.27 
 
 
255 aa  248  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  46.27 
 
 
255 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  46.27 
 
 
255 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  45.88 
 
 
255 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.88 
 
 
255 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  45.88 
 
 
255 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  47.62 
 
 
253 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  46.46 
 
 
256 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  45.88 
 
 
255 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  47.84 
 
 
606 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.31 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.49 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  45.67 
 
 
457 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 
256 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  50.86 
 
 
261 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  46.85 
 
 
255 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  45.56 
 
 
462 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  42.41 
 
 
256 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  45.53 
 
 
462 aa  235  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  45.85 
 
 
256 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 
255 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.8 
 
 
458 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  43.8 
 
 
458 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  42.58 
 
 
257 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  42.58 
 
 
257 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  45.02 
 
 
258 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  41.02 
 
 
256 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  43.03 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.8 
 
 
461 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  41.18 
 
 
251 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  39.04 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  40.16 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.49 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  39.44 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  40.16 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 
258 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  43.87 
 
 
251 aa  210  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  40.31 
 
 
263 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
263 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 
254 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 
263 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
262 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.41 
 
 
264 aa  208  7e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  41.54 
 
 
258 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  41.54 
 
 
258 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  40.32 
 
 
459 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  42.08 
 
 
259 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.78 
 
 
255 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 
258 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  41.54 
 
 
258 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.9 
 
 
268 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.39 
 
 
255 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.52 
 
 
261 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40.15 
 
 
267 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  44.14 
 
 
273 aa  205  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
269 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 
264 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  40.7 
 
 
259 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  40.7 
 
 
259 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  40.7 
 
 
259 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  42.53 
 
 
262 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  40.7 
 
 
260 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.71 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  40.71 
 
 
262 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  40.84 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  43.85 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  40.71 
 
 
271 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  40.84 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  41.22 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 
257 aa  199  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 
259 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 
256 aa  198  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 
259 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  41.86 
 
 
257 aa  198  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  42.15 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  40.71 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  39.37 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  42.13 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  45.02 
 
 
257 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>