More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 312 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  53.4 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 		 310 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  42.86 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  41.75 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  43.69 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.44 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  51.49 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.27 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  38.19 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.95 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.37 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  49.3 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  44.96 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.08 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  48.44 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  48.85 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 330 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 		 348 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  51.11 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  40.51 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.53 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.25 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.8 
 
 		 343 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.25 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  40.71 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  40.82 
 
 		 320 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.62 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  39.29 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  38.19 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.41 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.41 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  40 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  40.45 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.81 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.32 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  40.32 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.28 
 
 		 333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.49 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  38.56 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  38.06 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.62 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.85 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  43.19 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  44.35 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  37.93 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.14 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  37.93 
 
 		 339 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  41.32 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  38.24 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  40.42 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  38.14 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  40.87 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  38.39 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  39.74 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.35 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  42.64 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.32 
 
 		 316 aa  207  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.44 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.05 
 
 		 411 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.1 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  44.44 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>