More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  68.42 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  59.13 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  56.59 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  56.86 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  56.86 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  54.81 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  53.23 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  52.24 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  57.22 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  55.62 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  46.19 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  53.3 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  46.7 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 		 177 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 180 aa  135  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  47.16 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 179 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 180 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 177 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  46.93 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  48.37 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 172 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  40.61 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 176 aa  121  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 281 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.38 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  32.58 
 
 		 187 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.38 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 183 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.38 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.38 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.38 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.38 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.38 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  42.25 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  39.6 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  39.55 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  39.88 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  38.85 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 173 aa  99  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  34.78 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 189 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 186 aa  98.2  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 184 aa  98.2  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.29 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  34.5 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  36.13 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 171 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>