More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0305 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 420 aa  831    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  72.62 
 
 		 420 aa  635    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  73.1 
 
 		 420 aa  633  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  72.21 
 
 		 421 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  71.97 
 
 		 421 aa  621  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  71.97 
 
 		 421 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  73.57 
 
 		 420 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  68.88 
 
 		 421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1757  preprotein translocase subunit SecY  73.01 
 
 		 352 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.28 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.04 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.07 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.47 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.07 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.17 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.69 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.69 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.2 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  44.69 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.58 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 		 437 aa  358  7e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  43.03 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  43.86 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  43.57 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.25 
 
 		 443 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.25 
 
 		 443 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 446 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  42.42 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.41 
 
 		 442 aa  339  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 446 aa  339  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  42.48 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  41.49 
 
 		 444 aa  338  7e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.72 
 
 		 445 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.58 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.45 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  41.59 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  41.23 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 447 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  41 
 
 		 446 aa  335  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.23 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  40.89 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  45.19 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  40.76 
 
 		 446 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  40.89 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  40.89 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 447 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  40.09 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.27 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  41 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  41 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  41.37 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  41.09 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.61 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  39.86 
 
 		 444 aa  329  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42.45 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  41.09 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  41.94 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  41.58 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  40.52 
 
 		 446 aa  325  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  40.43 
 
 		 452 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.39 
 
 		 443 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  40.43 
 
 		 452 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.15 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  40.76 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  40.52 
 
 		 446 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  40.52 
 
 		 446 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  40.52 
 
 		 446 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  39.58 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  41.79 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  39.44 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.67 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  39.23 
 
 		 453 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>