105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4527 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  80.97 
 
 
268 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  42.58 
 
 
249 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  41.48 
 
 
269 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  42.44 
 
 
262 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  33.72 
 
 
263 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  39.39 
 
 
261 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  42.46 
 
 
270 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.33 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  35.83 
 
 
322 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  34.72 
 
 
299 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  37.4 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  36.86 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  35.92 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.89 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  36.89 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  30.28 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  38.27 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  33.89 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  35.52 
 
 
331 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  31.06 
 
 
271 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  29.34 
 
 
307 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  37.84 
 
 
264 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  31.78 
 
 
355 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  31.4 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  29.96 
 
 
238 aa  95.1  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  34.54 
 
 
380 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  32.11 
 
 
379 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  35.43 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  30.34 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  35.12 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  29.58 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  28.71 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2293  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.47 
 
 
602 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  37.68 
 
 
454 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  32.98 
 
 
326 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.84 
 
 
614 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  27.74 
 
 
618 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  35.37 
 
 
593 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  31.37 
 
 
362 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.26 
 
 
604 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
609 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.7 
 
 
272 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  25.93 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  27.67 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.91 
 
 
376 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  31.33 
 
 
296 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  27.39 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  26.88 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.96 
 
 
688 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  37.29 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.24 
 
 
645 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  26.81 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.66 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  27.18 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  25.71 
 
 
645 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.32 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  27.51 
 
 
345 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.04 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  24.52 
 
 
306 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.37 
 
 
656 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  38.14 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.64 
 
 
645 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  24.52 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.31 
 
 
323 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  32.03 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  32.47 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  32.53 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
372 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  33.19 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.38 
 
 
672 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  33.19 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.89 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  31.53 
 
 
644 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0703  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.4 
 
 
621 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  36.13 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.52 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  29.52 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.15 
 
 
645 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.45 
 
 
1094 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.15 
 
 
645 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.62 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0403  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.57 
 
 
588 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.892602  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  30.33 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  34.25 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0447  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.96 
 
 
599 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  29.73 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  30.82 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1764  putative hydrolase  22.6 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35222  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  27.24 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  28.07 
 
 
405 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  30.77 
 
 
415 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  26.96 
 
 
272 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  26.61 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  24.9 
 
 
414 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  24.9 
 
 
414 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>