More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1019 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  50.57 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  44.27 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  44.19 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  31.5 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.91 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.55 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.31 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.42 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.52 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.7 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.7 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.7 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.7 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.81 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  45.16 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.56 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  39.34 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  43.86 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  42.98 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.84 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>