More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2330 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  42.69 
 
 
275 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
275 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
260 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
291 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
264 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
261 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
261 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
262 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
259 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
262 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
263 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
271 aa  193  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.91 
 
 
258 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
264 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 
266 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.98 
 
 
258 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
258 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
264 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.45 
 
 
266 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.13 
 
 
258 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
263 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
256 aa  185  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  39.92 
 
 
267 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
261 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
262 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
261 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  39.3 
 
 
259 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
271 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.23 
 
 
257 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  38.86 
 
 
259 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
267 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.23 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.39 
 
 
259 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.2 
 
 
260 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
344 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  43.52 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
258 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
266 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.97 
 
 
260 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
260 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
257 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
260 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
262 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
257 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
272 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
255 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
257 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
262 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
284 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
286 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
360 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
265 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
258 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
289 aa  151  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
259 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
260 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.45506 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
267 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  39.38 
 
 
264 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
298 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.09 
 
 
261 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
271 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
343 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.8 
 
 
265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
260 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
223 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
281 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
281 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
268 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
266 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.39 
 
 
265 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
259 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
264 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 
266 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
262 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
266 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
266 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>