More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1687 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  68.57 
 
 		 210 aa  308  4e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 209 aa  127  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  37.44 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  30.32 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  35.68 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.38 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  31.65 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 258 aa  99  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  38.21 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 246 aa  98.2  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  42.54 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  28.44 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  38.28 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  32.81 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.41 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  28.99 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.41 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  43.88 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  29.86 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  32.24 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  31.78 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  29.39 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  28.7 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  28.7 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  29.19 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  36.21 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  32.12 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  30.84 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  36.97 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  39.67 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  32.31 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  27.97 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  29.18 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  36.07 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  26.87 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  29.05 
 
 		 264 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.47 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  28.76 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  27.95 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 235 aa  85.1  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  31.71 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  40.59 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  28.86 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>