More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9212 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
283 aa  561  1e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  53.52 
 
 
282 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  47.5 
 
 
286 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
275 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  34.78 
 
 
275 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  33.7 
 
 
275 aa  140  2e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
275 aa  140  2e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
502 aa  132  4e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  35.29 
 
 
258 aa  129  8e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
265 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
268 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
291 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
258 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
260 aa  121  1e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
252 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
284 aa  116  4e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
269 aa  111  1e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  32.62 
 
 
270 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.6 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.92 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
277 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
287 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
277 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.75 
 
 
265 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
280 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 
392 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  30.77 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.58 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  28.77 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
339 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.36 
 
 
263 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
263 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.85 
 
 
261 aa  85.5  1e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
270 aa  85.1  1e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
275 aa  84.7  2e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.41 
 
 
274 aa  84.3  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
270 aa  84  3e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  27.27 
 
 
275 aa  83.2  4e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
294 aa  82.8  5e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
262 aa  83.2  5e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
323 aa  82.4  7e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.57 
 
 
264 aa  82.4  7e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
284 aa  82.4  8e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.52 
 
 
283 aa  82.4  8e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 
263 aa  82  9e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
302 aa  82  9e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
259 aa  81.6  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
279 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 
260 aa  82  1e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
267 aa  81.6  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  30.11 
 
 
262 aa  80.9  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
277 aa  81.3  2e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72829e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
274 aa  81.3  2e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
226 aa  81.3  2e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.82 
 
 
396 aa  80.1  3e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
278 aa  80.5  3e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  1.0023e-06 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
298 aa  80.1  4e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.45 
 
 
285 aa  79.3  6e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
277 aa  79.3  6e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
276 aa  79.3  7e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  1.12067e-09 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.36 
 
 
397 aa  79.3  7e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.48 
 
 
264 aa  79.3  7e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.93 
 
 
387 aa  79.3  7e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.75 
 
 
262 aa  79.3  7e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
272 aa  79.3  7e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
276 aa  79.3  7e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  2.39826e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
266 aa  79  8e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 
283 aa  79  8e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.22 
 
 
425 aa  79  8e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.97 
 
 
273 aa  79  8e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
275 aa  78.2  1e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
272 aa  78.2  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  36.67 
 
 
233 aa  78.6  1e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 
256 aa  78.6  1e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
276 aa  78.2  1e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.29 
 
 
286 aa  78.6  1e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
265 aa  78.2  1e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.47 
 
 
259 aa  78.2  1e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 
264 aa  77.8  2e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  27.96 
 
 
263 aa  77.8  2e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
302 aa  77.8  2e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
264 aa  77.8  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  37.62 
 
 
262 aa  77.4  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
263 aa  77.4  2e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  35.83 
 
 
233 aa  77.4  3e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  26.22 
 
 
277 aa  77  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
315 aa  77  3e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>