More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7945 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 633 aa  1251    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  61.35 
 
 		 662 aa  700    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  46.15 
 
 		 673 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  45.09 
 
 		 647 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  42.93 
 
 		 665 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  43.93 
 
 		 631 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  44 
 
 		 626 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  41.25 
 
 		 653 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  35.12 
 
 		 621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  32.21 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  34.39 
 
 		 623 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.58 
 
 		 600 aa  296  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 616 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 616 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  32.03 
 
 		 614 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  36.08 
 
 		 625 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  34.85 
 
 		 625 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  37.55 
 
 		 615 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 626 aa  273  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.17 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  36.64 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  31.79 
 
 		 611 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  33.33 
 
 		 613 aa  264  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  34.56 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  33.65 
 
 		 611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 		 618 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  32 
 
 		 621 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  31.47 
 
 		 604 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  31.86 
 
 		 621 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  37.11 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  37.35 
 
 		 615 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  31.84 
 
 		 621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  33.33 
 
 		 623 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  30.05 
 
 		 613 aa  250  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  33.55 
 
 		 603 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  24.96 
 
 		 608 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  32.26 
 
 		 606 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  34.7 
 
 		 626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 603 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.23 
 
 		 605 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  30.67 
 
 		 626 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.82 
 
 		 611 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 616 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.38 
 
 		 619 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.15 
 
 		 619 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  32.62 
 
 		 619 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.88 
 
 		 594 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.82 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.14 
 
 		 597 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  29.9 
 
 		 618 aa  220  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  34.04 
 
 		 608 aa  216  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.08 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33 
 
 		 633 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  32.75 
 
 		 625 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.8 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  33.73 
 
 		 595 aa  210  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  31.34 
 
 		 605 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  30.38 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 608 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  24.46 
 
 		 603 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.94 
 
 		 603 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  30.49 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  24.8 
 
 		 591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  34.88 
 
 		 500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  34.93 
 
 		 578 aa  200  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  46.99 
 
 		 600 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  43.67 
 
 		 705 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  24.92 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  27.54 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  31.13 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.34 
 
 		 739 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 623 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 602 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  43.98 
 
 		 728 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  40.46 
 
 		 627 aa  193  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  43.98 
 
 		 728 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  45.49 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.2 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  40.31 
 
 		 753 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  25.81 
 
 		 588 aa  191  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  41.46 
 
 		 726 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.23 
 
 		 736 aa  190  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  40.71 
 
 		 725 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  43.46 
 
 		 724 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.25 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  43.46 
 
 		 724 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.8 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  41.94 
 
 		 731 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.97 
 
 		 605 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 611 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.02 
 
 		 614 aa  187  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  25.81 
 
 		 596 aa  187  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  38.31 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  38.31 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.4 
 
 		 628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>