More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5917 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  63.6 
 
 		 1184 aa  1528    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  42.02 
 
 		 1196 aa  861    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.04 
 
 		 1132 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  44.98 
 
 		 1182 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.7 
 
 		 1132 aa  763    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  48.74 
 
 		 1223 aa  1098    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  49.33 
 
 		 1215 aa  1107    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  45.11 
 
 		 1150 aa  866    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.23 
 
 		 1132 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.31 
 
 		 1133 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.31 
 
 		 1133 aa  755    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  47.14 
 
 		 1176 aa  1059    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  74.2 
 
 		 1158 aa  1794    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  45.17 
 
 		 1182 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  43.32 
 
 		 1187 aa  1020    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  50.55 
 
 		 1171 aa  1089    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  65.38 
 
 		 1193 aa  1522    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  100 
 
 		 1154 aa  2356    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  47.91 
 
 		 1178 aa  1084    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  44.75 
 
 		 1191 aa  1031    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  43.79 
 
 		 1188 aa  1014    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  44.09 
 
 		 1149 aa  839    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  66.04 
 
 		 1173 aa  1584    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  62.54 
 
 		 1181 aa  1488    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  46.85 
 
 		 1208 aa  1055    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  48.78 
 
 		 1208 aa  1095    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.31 
 
 		 1132 aa  754    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.35 
 
 		 1136 aa  781    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.23 
 
 		 1132 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  41.8 
 
 		 1163 aa  916    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  43.34 
 
 		 1188 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  48.86 
 
 		 1190 aa  1069    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  49.66 
 
 		 1182 aa  1067    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  41.91 
 
 		 1208 aa  880    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  45 
 
 		 1150 aa  880    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.93 
 
 		 1169 aa  806    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  47.09 
 
 		 1191 aa  1083    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  75.69 
 
 		 1156 aa  1793    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  66.64 
 
 		 1192 aa  1602    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  50.55 
 
 		 1168 aa  1098    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.62 
 
 		 1132 aa  760    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  40.9 
 
 		 1180 aa  853    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  61.11 
 
 		 1214 aa  1451    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  70.27 
 
 		 1171 aa  1644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  69.9 
 
 		 1195 aa  1611    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.04 
 
 		 1132 aa  747    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.34 
 
 		 1156 aa  899    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.13 
 
 		 1132 aa  753    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  46.59 
 
 		 1212 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  41.11 
 
 		 1254 aa  864    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  70.29 
 
 		 1178 aa  1664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  53.75 
 
 		 1151 aa  1172    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  46.13 
 
 		 1197 aa  1044    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  44.94 
 
 		 1224 aa  1040    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  73.57 
 
 		 1169 aa  1732    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  70.02 
 
 		 1167 aa  1637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  42.6 
 
 		 1189 aa  852    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  45.02 
 
 		 1150 aa  863    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  61.93 
 
 		 1216 aa  1457    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  78.48 
 
 		 1157 aa  1883    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  40.68 
 
 		 1136 aa  794    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  47.09 
 
 		 1191 aa  1083    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  66.92 
 
 		 1158 aa  1569    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  65.34 
 
 		 1199 aa  1540    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.82 
 
 		 1132 aa  744    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  66.33 
 
 		 1176 aa  1591    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  81.54 
 
 		 1154 aa  1993    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  46.6 
 
 		 1214 aa  1054    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  48.22 
 
 		 1183 aa  1107    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  43.38 
 
 		 1188 aa  1022    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  33.91 
 
 		 1266 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  34.27 
 
 		 1232 aa  592  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  33.69 
 
 		 1237 aa  588  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  33.55 
 
 		 1245 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  34.4 
 
 		 1251 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 		 1226 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  34.43 
 
 		 1243 aa  581  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  33.17 
 
 		 1239 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  32.67 
 
 		 1227 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  33.96 
 
 		 1232 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1233 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  33.2 
 
 		 1262 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  31.97 
 
 		 1226 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  34.98 
 
 		 1264 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  34.98 
 
 		 1264 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  32.89 
 
 		 1231 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  32.37 
 
 		 1226 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1230 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1230 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  34.96 
 
 		 1220 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  33.85 
 
 		 1250 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  32.39 
 
 		 1228 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  32.65 
 
 		 1227 aa  572  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  32.76 
 
 		 1267 aa  571  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  31.62 
 
 		 1274 aa  572  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.77 
 
 		 1236 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  32.51 
 
 		 1226 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  32.24 
 
 		 1261 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  33.69 
 
 		 1278 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  32.54 
 
 		 1238 aa  568  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>